Baihakki Khaizan menyertai semula LionsXII selepas digugurkan daripada Johor Darul Ta'zim (JDT) bulan lepas. Baihakki menyertai JDT musim ini dan bermain semua perlawanan tetapi tidak bermain dalam salah satu daripada 10 perlawanan Super Liga semasa beliau di sana. Aidil Zafuan bermula sebagai rakan pertahanannya sebelum beralih kepada Fadhli Shas selepas partnership mereka tidak seperti yang diharapkan.
Apabila bercakap tentang pembatalan kontrak Baihakki bulan lepas, Presiden Persatuan Bola Sepak Johor, Tunku Ismail Sultan Ibrahim (TMJ) berkata Baihakki ialah pertahanan yang baik tetapi JDT memerlukan seseorang yang lebih banyak pengalaman antarabangsa untuk bersaing dengan penyerang asing.
Dalam temu bual dengan A Cross The Line, Baihakki mengulangi bahawa beliau tidak memendam dendam dengan cara yang pemecatnya dari JDT .
"Dikeluarkan daripada pasukan adalah sebahagian daripada bola sepak ; tidak ada dendam sekalipun. Malah, (Tunku Ismail) sangat baik dan memahami keadaan saya. Penamatan kontrak saya adalah berdasarkan pemahaman bersama, dan menyertai LionsXII akan membenarkan saya untuk berusaha ke arah memenangi tempat dalam akhir tahun Piala AFF Suzuki dengan pasukan kebangsaan Singapura. "
Baihakki menandatangani perjanjian menyertai semula LionsXII selama 7 bulan tetapi mempunyai klausa dalam kontrak yang menyatakan bahawa dia tidak dapat bermain menentang JDT dalam sebarang pertandingan bagi keseluruhan musim 2014. Situasi yang meletakkan dia keluar dari perdebatan bagi perlawanan antara kedua-dua pasukan pada 20 Mei 2014 .